$$('a[href^=#]').each(function(el) {
el.addEvent('click',function(){
var head_height = 97;
href = this.getProperty('href');
anchor_offset = $$(href).getLast().getPosition().y;
window.scrollTo(0, anchor_offset - head_height);
return false;
});
});
Но сейчас это в ряд ли решение самом по себе, т.к. использую knockout в текущем проекте.