Если по уму, то следует сначала выполнить миграцию, которая создаёт дополнительную таблицу, потом
создать и выполнить миграцию данных, а потом выполнить миграцию удаляющую поля из исходной таблицы. Либо выполнить команду
dumpdata, выполнить миграцию, а потом накидать простенький скриптик, который набьёт новую таблицу предварительно сохранёнными данными.