Причина точно не в софте. Снимите крышку системника, отсоедините провода, идущее от передней панели к материнской плате(предварительно запомните, что где было) и заново подсоедините. Можно еще тестером проверить светодиод. Еще можно попробовать(хотя я не уверен) временно поменять на материнке местами провода hdd led и power led(искать по надписям на материнке или самим проводам).