core.autocrlf отвечает только за файлы в репозитории (первая колонка git ls-files --eol), но не на локальной машине (вторая колонка). После клонирования репозитория и редактирования файлов нужно обратить внимание, чем заканчивает строки ваш редактор.
размер изображений карты нужно уменьшать вдвое на retina дисплеях
detectRetina: true стягивает тайлы и увеличивает масштаб (это хак, как написал Moskus, но является ответом на вопрос автора). Другие параметры менять не нужно (разве что можно уменьшить maxZoom).
git cloneсоздаёт клон, но не форк на GitHub-е. Для форка обязательно нужно использовать кнопку Fork на сайте.