Знаете, я только сейчас понял, что дерево в списке процессов на вашем скриншоте растет снизу вверх и к Сфинксу это не имеет никакого отношения, а имеет отношение к крону, который ниже.
Если задача на очистку есть, то проблема не в самом очистке, а в том, что она по каким-то причинам не выполняется. Например, нет прав. Т.е. через какое-то время проблема может повториться.
А вы можете посмотреть не логи nginx, а вывод ab. Например:
Complete requests: 5000
Failed requests: 4536
(Connect: 0, Receive: 0, Length: 4536, Exceptions: 0)
> ssh-соединение есть все сделать на ключах запускает секунды 4. Это такая большая проблема?
Это не слишком большая проблема, но если возможно, хочется сделать все правильно.
Добавлю, что нужно заранее загрузить страницу, которая использует этот код, а после применения её нужно «перезагрузить из кеша». Соответствующий пункт есть в меню «средства разработки».