У вас все ломает новый label от jquery validation. Есть метод errorPlacement в jquery validation, в котором вы можете указать, куда поместить элемент с ошибкой, например так:

errorPlacement: function (error, element) {
    if (element.attr("type") == "checkbox") {
        return element.next('label').append(error);
    }

     error.insertAfter($(element));
}

В папке vendor вносить изменения нельзя. Если вам нужно было изменить логику для Auth/Passwords, то можно было попробовать этот вопрос решить путем написания кода в app/http/controllers/auth/PasswordController файле

https://jqueryvalidation.org/validate/ submitHandler вам в помощь

Если правильно понял вопрос, то:
$shops = Shop::doesntHave('customer')->get();