Выношу из комментов:
В документации нет removeControl ;)
Вообще элементы управления удаляются через map.controls.remove('searchControl').
Но в вашем случае, насколько я понимаю, достаточно задать список нужных контролов прямо в конструкторе карты.
https://tech.yandex.ru/maps/jsbox/2.1/customSet_co...
https://tech.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.1/ref/refe...
Хотя я не очень понимаю, зачем убирать стандартные элементы управления.
