Организуйте примерно так:
* windows 2016 server core (включите дедупликацию)
1. ssd на 64 гига загрузочный
2. 2 диска в 1 raid - кстати что за рэйд контроллер? если встроенный в мать то используйте софт рэйд
3. 1 диск большого объема, для всякого хлама типа сериалов музыки и т.д.
А вот 0 рэйд на файлопомойке явно не нужен, у вас какая сетка гигабит? Какие контроллеры? Собственно и все.