Первое впечатление - антинаучный вопрос. Сервер под Винду или линух ?
Сервер под 1.6 - какая крайняя 32 уьунта была ? Не легче её поставить ?
А вообще поставь виртуалку и на нее ую32 убунту
допустим.
а вот про это :"но изначально вопрос другой - из 1с нужно выгружать несколько цен, или же битрикс сам должен высчитывать от базовой?
если должен сам - тогда как включить расширенный режим для всех sku и включить группу цен и наценку ?"
Удачи вам во всех ваших умениях