1) Это нужно делать на сервере, не на клиенте. Очень важно!
2) Записываете время последней отправки SMS
3) Если разница в минутах между текущим временем и временем отправки SMS меньше N минут, показать ошибку.
Если у вас PHP:
Про сравнение двух дат почитайте - DateTime::diff и DateInterval