А что вы хотите от дизайна бизнес-процесса?
С ходу можно найти 3 разных варианта:
1. Если речь о том чтобы нарисовать схему, то подойдет
www.lucidchart.com/ или
cacoo.com/
2. Если речь о том чтобы описать бизнес процесс так чтобы затем по ним работал человек и можно было обучать сотрудников, подойдет любая wiki, мы используем WordPress.
3. Если описать логику для разработки какого то блока в 1С, то лучше структурировать задачи через макетирование интерфейса (https://moqups.com/) и описание логики элементов в форме интеллект-карты (https://www.mindmeister.com/)