меня интересует только единицы измерения
они никак не связаны с flexbox и с адаптивностью. Или правильнее сказать связаны косвенно. Вы можете использовать любые единицы или их комбинации.
Адаптивность сайта это комплекс мер. Что-то достигается благодаря использованию flexbox, что-то медиазапросами, что-то относительными единицами. И одно не исключает другого. Одни блоки могут быть в одних единицах, другие в других. Шрифты могут быть в третьих.
Дать совет по использованию тех или иных единиц можно только на примере участка верстки в конкретном проекте, а не дизайна в целом в абстрактном проекте.
Опытный верстальщик смотрит на дизайн и продумывает, как будет реализовать адаптивность того или иного блока, соответственно наметив себе план по каждому куску принимает решение в пользу тех или иных единиц, методов адаптивности и т.д. И подчеркну, никто не запрещает Вам использовать разные единицы, не стоит выбирать для всего проекта допустим % и потом городить что попало, только чтобы не перейти на px.
