Вы не можете показывать отдельные надписи в пределах одного типа надписей (то есть, нельзя какие-то подписи городов показать, а другие скрыть).
Решение несложное:
1. Скройте все стандартные надписи.
Для этого нужно указать при создании свойство styles, код которого можно получить через вот этот мастер:
gmaps-samples-v3.googlecode.com/svn/trunk/styledma...
2. Самостоятельно создайте слои на карте с подписями двух городов, разместите их в координатах этих городов. Делать это придётся через google.maps.OverlayView — другие стандартные символы (Market, Icon, Symbol etc) вам не подойдут.