Я так понял вас интересует установка определенных пакетов без зависимостей (что делать нежелательно), если так, то вам нужна команда: rpm -ivh --nodeps <пакет>
Раз после отвисания " наверстывает упущенное", значит скорее всего контакт с мышью не прерывается и проблему надо искать в самой системе, драйвера мат. платы, мыши, usb концентратора, либо какое-то ПО