Это вы чего тут нагородили?
Все файлы с расширением php просто проксируйте на апач
Остальную статику типа jpg, css, html, js и т.д. отдавайте напрямую nginx`ом
Если необходимо чтобы все домены имели ns-ы одного вашего домена то можно поднять dns сервер на своем домене, только нужно будет иметь для поддоменов вида ns.youdomen.ru разные ip класса С. Ну и лучше чтобы каждый поддомен находился на физически разных серверах в физически разных ДЦ (это необходимо для стабильной работы если будут проблемы в одном из ДЦ).