Reset Safari, как я понял, не помог.
В ~/Library/Caches/com.apple.safari посмотреть можно (cache.db у меня ~150 мб, стартует на i5 ощутимо быстрее).
Можно создать нового пользователя, посмотреть как там.
Чтоб отсечь проблемы с винтом (а на это похоже), можно поставить макось на внешний HDD.