#main:after {
display: block;
content: "";
clear: both;
}<a class="to-top color-bg">...</a>) внутри футера, у которого свойство z-index=2, ниже, чем у других блоков. position:fixed; /*соответственно поправить ее коордианты*/
z-index:99; /*значение, чтобы перекрыть другие блоки*/a.menu_item:after {
display:block;
content: "";
width:5px;
height:5px;
border-radius:5px;
background-color: grey;
}
a.menu_item:hover:after {
background-color: red;
}<meta name="robots" content="noindex">.