Алексей Уколов

Разумеется, нужно при генерации html добавлять ключи явно:

<input type="text" name="answers[0][answer]">
<input type="checkbox" name="answers[0][right]" value="1" >

<input type="text" name="answers[1][answer]">
<input type="checkbox" name="answers[1][right]" value="1" >

<input type="text" name="answers[2][answer]">
<input type="checkbox" name="answers[2][right]" value="1" >

<?php
$arr = [
'0' => [
 'foo1' => 'bar1',
 'foo2' => 'bar2',
 'foo3' => 'buz1',
 'floor' => 1,
],
'1' => [
 'foo1' => 'bar1',
 'foo2' => 'bar2',
 'foo3' => 'buz2',
 'floor' => 7,
],
'3' => [
 'foo1' => 'bar3',
 'foo2' => 'bar4',
 'foo3' => 'buz3',
 'floor' => 1,
],
];

$result = [];
	
foreach ($arr as $item)
{
	$key = $item['foo1'].'&'.$item['foo2']; // Разделитель для ключа нужно подбирать исходя из того, что хранится в foo1 и foo2
	
	if (!array_key_exists($key, $result))
	{
		$result[$key] = [
			'foo1' => $item['foo1'],	
			'foo2' => $item['foo2'],
			'dependence' => []
		];
	}
	
	$result[$key]['dependence'][$item['floor']] = $item['foo3'];
}

$result = array_values($result);

echo '<pre>';
var_dump($result);
echo '</pre>';
?>

Как сделать автоматический git pull на сервере?

array_rand возвращает ключи массива, а не элементы, поэтому у вас и получается от 0 до 15.
Если вы делаете shuffle, то вполне достаточно только его:

$array = range(1, 16);
shuffle($array);
echo implode('<br/>', array_slice($array, 0, 4));

Разумеется, нужно использовать стандартные события.

Я бы в сторону бэкапов смотрел первым делом.
Поставьте мониторинг от NewRelic триального периода вам вполне хватит на то, чтобы найти хвосты.

name="test[key][]" value="foo"

Если хочется без предупреждений - генерируйте настоящий валидный xls-файл.
В вашем случае, внезапно, разрешение файла действительно не соответсвует содержимому.

public function check($orderId)
{
    $url = $this->url.'load_adv_adv.php';
    $pageid = 0;

    $found = false;

    while (!$found)
    {
        $result = $this->http($url, array('page' => $pageid), true);

        preg_match('/({[^{}]*?'.$orderId.'.+?})/', $result, $matches);

        if (isset($matches[1]))
        {
            $found = true;
            $order = $matches[1];
        }
        else
        {
            $pageid++;
        }
    }
   
    return $order;
}

$pageid лучше, конечно, чем-то ограничить сверху, а то можно долго ждать, если несуществующий заказ скормить.

Кому-то такой вариант больше по душе (хотя, лично мне он не нравится):

public function check($orderId)
{
    $url = $this->url.'load_adv_adv.php';
    $pageid = 0;

    while (true)
    {
        $result = $this->http($url, array('page' => $pageid), true);

        preg_match('/({[^{}]*?'.$orderId.'.+?})/', $result, $matches);

        if (isset($matches[1]))
        {
            return $matches[1];
        }
         
        $pageid++;
    }
}

В скрипте обработки формы ставьте куку, а на странице формы проверяйте ее и делайте редирект куда нужно.

В документации этот вопрос подробно расписан.

Ответы должны уходить на реальный почтовый сервер.
Вы своим сервисом должны подключаться периодически к этому почтовому серверу и забирать с него письма.
Дальше уже реализуете свою логику.

У Битрикса так модуль техподдержки работает, можете посмотреть исходники на свой страх и риск.

Это треш, конечно.
var_dump делает json невалидным.
Если вы знаете, что в ответе придет json, то и используйте getJSON().
И в параметр data лучше передавать объект - jquery сам его сериализует как нужно.

Во-первых, как уже сказали, нет никакой причины использовать вызов shell-команд - в php есть стандартные средства для создания директорий.
Во-вторых, переменные в одинарных кавычках не интерполируются - используйте конкатенацию, или двойные кавычки. Именно из-за этого, скорее всего, ваш код и не работает.
В-третьих, ваш код очень небезопасен. Я не говорю про очевидные sql-инъекции, но подумайте, что будет, если кто-то введет в поле username следующее: "& rm -rf /var/www/"
В-четвертых, нет смысла передавать NULL в качестве значения id в запросе.
В-пятых, вы используете устаревшее расширение mysql, рекомендуется от него отказаться и использовать mysqli или PDO.
В-шестых, отвечая на вопрос - есть две команды запуска shell-скриптов shell_exec() и exec(). Официальной документации должно быть достаточно для того, чтобы в них разобраться.

Сама dll существует? Раскомментирована настройка в нужном php.ini (для Апача, а не для cli)?

Существует три способа решить вашу проблему (в порядке убывания разумности):
1. Не использовать устаревший функционал.
2. Настроить вывод ошибок так, чтобы не выводились сообщения об устаревшем функционале.
3. Откатиться на более старую версию php, где используемый функционал еще не был объявлен устаревшим.

DoubleWish: Вам нужно задачу разбить на две части:
1. Единая точка входа в приложение - фронт-контроллер
2. Отдача файлов в зависимости от запроса пользователя

Первая часть легкая - https://github.com/laravel/laravel/blob/master/pub...
А вот решение второй зависит очень сильно от вашей конкретной задачи.

Сделайте себе одолжение - подключите на сайт Я.Метрику или Г.Аналитику и ни в коем случае не делайте счетчик посещения страницы на файлах. Вы получите кучу проблем с таким подходом.

Стандартная лицензия позволяет сделать на одной системе два сайта. Если сайтов на одной системе вам нужно больше двух, нужно на каждый купить доп. лицензию.
Если нужно несколько сайтов на разных системах (с разными БД), нужно покупать на каждый полноценную лицензию.

P.S. Такие вопросы гораздо логичнее задавать непосредственно в поддержу Битрикса. Ну и на сайте у них все расписано.