Хуршед Абдужалил

Провозился. Добавлю, чтобы не забыть.
Пытался отправить через ящик, зарегистрированный на pdd.yandex.ru и получал ошибку
503 5.5.4 Error: send AUTH command first.
Оказалось, надо было войти в ящик через веб-интерфейс и заполнить поля.

Yii2 - это php framework. Любой js framework будет на него не похож.
Ваш вопрос звучит так: "Помогите подобрать микроволновку, похожую на унитаз, я сантехник, что бы проще было с ней разобраться" - без обид, просто чтобы проиллюстрировать алогичность
Это две совершенно разные вещи. Framework для backend на php и js для frontend. Они не могут быть похожи.

Довольно хорошо знаю Yii2

ложное утверждение, учитывая вопрос. Мой совет, закончите изучать то что начали.

Попробуйте без подзапросов:

SELECT count(DISTINCT product.id)
    FROM `product`
    JOIN `product_to_city` ON `product`.`publish` = 1 
        AND `product`.`archive` != 1 AND `product`.`delete` != 1
        AND `product_to_city`.`product_id` = `product`.`id`
    JOIN `city` AS `c` ON (`c`.`id` = 104 OR `c`.`parent_id` = 104)
        AND `c`.`id` = `product_to_city`.`city_id`
    JOIN `city` ON `city`.`id` = `product`.`city_id`
    JOIN `company` ON `company`.`id` = `product`.`company_id`