Что касается Windows , как уже подметили несколько аспектов касающихся AD, EXCH и тому подобных сервисах их знать нужно, правда. Чтобы собрать Exch 2013 вообще знать ничего не нужно, собирается по "далее", "далее", "готово". Если уйти чистым Linux'м то нужно обязательно знать какой-нибудь язык скриптования, это к примеру - bash/python/perl/ruby. Хорошо ориентироваться в выбранном дистрибутиве. Выбрать для себя любимый текстовый редактор, потому что 99.9% ты будешь работать из консоли, тут очень хорошо подойдёт vim, мне лично очень нравится! Далее необходимо ориентироваться в mysql. Уметь настраивать сеть, под разными углами, будь то vlan, vpn, либо же маршрутизация. Знать системы мониторинга, к примеру Nagios/Graphite/Zabbix/Fluentd. Мне лично Забикс нравится. И если мы берём большие конторы, это работа с High-availability, это у нас haproxy, corosync, redis, rabbitmq, pacemaker, heartbeat и т.д. Последнее к сожалению дома не соберёшь, если конечно у тебя нету пару ненужных серверов. И на последок, нужно уметь диагностировать на лету систему, будь сколько потоков в процессоре, сколько памяти, как нагружен сервер, какие приложения он использует, если у нас забита память нужно узнать какое приложение его поглощает, детально знать что куда идёт. Если это все знать, примерно на 80-120 т.р. можно устроится