Если Ваши последовательности совершенно случайно имеют отношение к биологии (и даже если нет) — у биоинформатики есть специализированные алгоритмы, типа BLAST.
На голову крепится ИК-светодиод, положение определяется пультом от Wii.
Wiimote отслеживает положение до 4-х ИК-источников, и по Bluetooth-каналу отдаёт готовые координаты (насколько я помню, разрешение камеры 1024x768, частота обновления 100 Гц).
Есть библиотеки на разных языках и для разных ОСей.
Есть proof of the concept от Джонни Чанг Ли.
Единственным условием, накладываемым Apache лицензией, является информирование получателя о факте использования исходного кода, лицензированного под лицензией Apache.
Он сам по себе перегрелся? Тогда это в гарантийку.
В противном случае, всё равно стоит спросить у службы поддержки — Logitech, например, в таких случаях высылает новый адаптер (иногда за деньги).