Ну, в первую очередь, вы должны понимать сами, нужен ли вам jQuery, или нет. Я jQuery использую только для legacy сайтов (где уже есть jQuery), для WordPress (т.к. там он из коробки, то почему бы и нет), для прототипов и landing-page, для чего-то сложнее нужны фреймворки.
Никогда не учил jQuery, но работать с ним умею. Если знаете css query, работу с dom, и сам JS, то вам хватит чтения документации и просмотра пары примеров. Не так много времени на это нужно. Не думаю, что вначале стоит заострять на этом внимание, по мере работы освоите, поэтому лучше учите чистый JS, потом переходите к фреймворкам.