Vindicar

Ну так у тебя библиотека для работы с discord не установлена. Почитай в документации, как её установить.

File "C:\Users\user\Desktop\.py Black list aio\handlers\add_guest.py", line 45, in get_iin
    await message.answer('')  # <--- вот тут

Тебе суперкритично --onefile? Режим одной папки не подойдёт?

Шаг 1: сделай на базе своего кода подпрограмму, которая делает то, что нужно, принимая в качестве параметра путь к zip-файлу и путь к целевой папке session.
Шаг 2: получи список путей к zip-файлам, подлежащих обработке
Шаг 3: для каждого файла вызови свою подпрограмму.

Что-то такое?

from collections import Counter
from collections.abc import Hashable

def combine_suggestions(user: list[Hashable], glob: list[Hashable]) -> list[Hashable]:
    uc = Counter(user)
    gc = Counter(glob)
    for key in uc:
        gc.pop(key, None)
    u = uc.most_common()
    g = gc.most_common()
    return [item[0] for item in (u + g)]

https://docs.python.org/3.9/library/collections.ht...

Во всех примерах это работает именно так...

Не верю.

bot.register_next_step_handler() принимает обработчик следующего сообщения, а не кнопки. Собственно, твоя функция и получает объект сообщения.

Рвётся коннект до телеграмма. Сеть - штука ненадёжная, может у провайдера админ пьяный, может, контакт плохой, может, РКН балуется.
Допиши скрипт, чтобы при ошибке соединения бот перезапускался.
Я бы начал с чего-то типа

import time
from requests.exceptions import RequestException

while True:
    try:
        bot.infinity_polling(timeout=10, long_polling_timeout = 5))
    except RequestException as err:
        print(err)
        print('* Connection failed, waiting to reconnect...')
        time.sleep(15)
        print('* Reconnecting.')

Первый вариант правильный, второй не очень.
Но есть два но:
1. Тебе важен только сам факт наличия картинки на экране, или нужны её координаты?
Если нужны координаты, то лучше сделать по умному, и не искать одну и ту же картинку дважды:

# перечисляешь в списке изображения. цикл остановится на первом найденном.
for image in ['link.png', 'link1.png']:
    location = pyautogui.locateOnScreen(image)
    if location is not None:
        break
else:
    image, location = None, None

Тогда дальше сможешь проверить, если location is not None - значит, что-то нашли. Что именно - лежит в image. Где именно - лежит в location.

2. Какая у тебя версия библиотеки pyautogui? Начиная с 0.9.41, вместо функция locateOnScreen(), не найдя изображение, не вернёт None, а выкинет исключение. Тогда код будет выглядеть как-то так:

for image in ['link.png', 'link1.png']:
    try:
        location = pyautogui.locateOnScreen(image)
    except pyautogui.ImageNotFoundException:
        pass
    else:
        break
else:
    image, location = None, None

Декорировать функцию после получения параметров. Не забывай, что

@formatter(p1, p2)
def csv_reader(filename, request):
    ...

эквивалентно

def csv_reader(filename, request):
    ...

_temp = formatter(p1, p2)
csv_reader = _temp(csv_reader)

Альтернативно, пусть возвращаемая фукнкция имеет свойства:

def formatter(parse_func):
    def output_func(*args):
        ...  # тут обращаемся к output_func.p1, например

    output_func.p1 = p1
    output_func.p2 = p2
    return output_func


@formatter
def csv_reader(filename, request):
    ...

csv_reader.p1 = a1
csv_reader.p2 = a2

Вместо функции можно вообще вернуть callable object, т.е. объект класса с методом __call__(), и любыми нужными свойствами и методами.

sqlite не поддерживает толком одновременную работу в нескольких потоках.

1. У тебя парсер? Перепиши код на асинхронный, тебе не сдалось на самом деле использовать потоки. Они 90% времени будут спать и ждать сетевого ответа. Асинхронный код выполняется в одном потоке, так что таких проблем не будет.
2. Создай отдельный поток, который будет заниматься только работой с базой, и общаться с остальными через какое-то api, например, кладём запрос, данные и какой-то id в очередь, потом читаем ответ из словаря. Но ты по факту будешь писать свой кривенький СУБД-сервер, так что...
3. Вместо sqlite используй любую полноценную СУБД, которая умеет параллельные соединения. Postrge, mariadb, что угодно.