Всё логично - явный запрет приорететней разрешений. ИМХО, правильное управление - пользователей в группы и группам уже назначаете права доступа. Избегайте выдачи прав конкретным пользователям на конкретные файлы. Продумайте структуру каталогов на файловом сервере, отталкиваясь от структуры отделов в компании (или проектов если у вас матричная структура подчинения)
важный upd: не давайте рядовым пользователям менять права на каталоги и файлы