Если боитесь чего-то такого, то лучше перестрахуйтесь, на всякий случай. Ну, для полного успокоения, так сказать.
Важный контент (документы, фотки) — в облако. Неважный (тот, что можно всегда восстановить из открытых источников) — куда-то на другой раздел (который впоследствии скрыть), в VHD-файл, либо вообще запаковать, переименовать в DLL и кинуть в C:\Windows. То есть, скрыть любым самым простым способом, который реализуется за 10 мин. Чтобы на первый взгляд нельзя было определить, и чтобы его удаление не принесло ущерба.
Насчет облака — если не хватит бесплатного DropBox'a или аналогичных сервисов — вон LiveDrive за $8.5 в месяц позволяет делать бэкап неограниченного размера. Аналоги тоже есть.