На мой взгляд литература тут не поможет. Вам необходимо просто начать полноценно работать с системой и сразу как только возникает какая нибудь проблема или необходимо что-то найти / установить / сделать, обращаться к Google.
Прежде чем я стал полноценным пользователем Linux, я поломал систему как минимум 3-4 раза.
После всех этих поломок и часами проведённых в попытке восстановить систему в обнимку с гуглом я могу с уверенностью сказать что система не ломается у меня теперь вовсе. Я уже полтора года являюсь Linux пользователм, довольно уверенно работаю с консолью и пишу не сложные Bash скриптики, и это не читая ни одну книгу.
Самое лучше обучение это самообучение. Тыкайте, нажимайте что видите, узнаете много интересного но скорее всего, в этом случае, вы поломаете систему, так что под рукой лучше держать установочный диск, на всякий случай)