У меня работает php и nginx от пользователя nginx, я обычно работаю под root
Скрипты должны запускаться от обычного пользователя. Соответственно файлы должны принадлежать ему же.
- Авторизоваться
su username
- Вернуться
exit
- Рекурсивно изменить владельца
chown -R username: /var/www/username
