Если у вас уже есть сайт на
юзернейм.github.io, то в настройках других репозиторий (где лежат ваши сайты) можно включить Github Pages так, чтобы они были доступны по пути
юзернейм.github.io/название_репозитория.
А в случае, если
юзернейм.github.io уже подключен к собственному домену - можно прикрутить отдельные поддомены под ваши сайты.
Upd. Возможно объяснил немного невнятно, лучше прочтите то что уже скинули и
вот это.