Azure AD Connect это для синхронизации текущего AD с Azure AD (насколько я понял из документации) и гибридного использования?в обоих случаях используется
Если у вас на сервере 20 ядер и 40 потоков, и вы все 40 потоков отдадите одной виртуальной машине, то вам будет нужно лицензия на 40 ядер.
в виртуальной потокис точки зрения лицензии это обычные ядра