Станислав: нет конечно, не надо делать аля sql. Храните все комменты в одном документе, пока 16мб документа не достигнете, потом будет сюрприз + вы уже столкнулись с проблемой в простейшей операции
chupasaurus: ну если вашему мега проекту хватит 20гб диска и 512 рамы, то океан лучшее что вы можете найти (хотя есть и подешевле). А так даже файлопомойку вы там не откроете, влетит в копеечку.