Missing Issuer: CN=Thawte Code Signing CA — G2, O=«Thawte, Inc.», C=US
Вам надо добавить этот сертификат в хранилище промежуточных (Intermediate) сертификатов. В вашем вопросе это
"intermediate CA certificate"
Запускайте mmc с правами администратора, добавляйте оснастку сертификатов (Add/Remove Snap-In -> Cerificates), далее импортируйте сертификат
CN=Thawte Code Signing CA — G2, O=«Thawte, Inc.», C=US
в хранилище промежуточных сертификатов и пробуйте снова.
Еще похоже у вас на компьютере, где проверяете сертификат, прикрыт интернет, или ходите через прокси. Для CryptoAPI, который используется командой certutil, параметры прокси настраиваются отдельно.