Смысл requestId в том, что бы оседлать в различных логах для дальнейшего анализа работы приложения.
Обычно он создаётся как можно раньше, если мы говорим про nginx, то там уже есть (начиная с 1.11.0) переменная $request_id, которую нужно а) писать в лог nginx и б) передавать дальше в PHP (с помощью fastcgi_param). Так же можно отдавать её в http-заголовке клиенту.
Дальше, по хорошему, ваше PHP-приложение во всех своих логах тоже должно сохранять это значение, а так же передавать во все другие сервисы с которыми оно общается (базы данных, другие http-сервера и т.п.).