Вы забыли указать
href. А в цветах у вас ошибка, пять нулей вместо шести.
Вот так всё работает
<svg viewBox="0 0 300 300" width="400">
<circle id="circle" r="30" cx="150" cy="150" />
<animate id="another" href="#circle"
attributeName="r"
values="30;50;30"
repeatCount="indefinite"
dur="3s"/>
<animate begin="another.begin" href="#circle"
attributeName="fill"
values="#000000;#ffe3e3;#000000"
repeatCount="indefinite"
dur="3s"/>
<animate begin="another.begin" href="#circle"
attributeName="cx"
values="150;180;150"
repeatCount="indefinite"
dur="3s"/>
</svg>