V Sh.

Если я ничего не путаю, то при создании проекта по шаблону у вас уже есть размеченная иерархия. Есть папка "Scripts" для скриптов, папка "Content" для хранения стилей. MVC - это совсем не про то, где и как хранить файлы. MVC - это про то, что все объекты и классы вы храните отдельно (по умолчанию папка "Models"), то, что вы хотите показать пользователю вы пишите также отдельно во View, а то, как View взаимодействует с вашими классами (логику) вы уже прописываете в контроллерах (Controllers).

что-то типа:

class test
{
public int[] arr;
public test(int N)
{
  arr = new int[N];
}
}