Как добавить чекбокс в пользовательский тип свойства инфоблока?

Можете добавить в init. Только не забудьте указать корректный неймспейс до вашего класса.

Bitrix\Main\EventManager::getInstance()->addEventHandler(
    'iblock',
    'OnIBlockPropertyBuildList',
    ['Checkbox', 'GetUserTypeDescription']
);

Как добавить чекбокс в пользовательский тип свойства инфоблока?

Keany, где удобнее, можете в init, можете в собственном модуле если работаете через него. Главное чтобы до момента вывода меню ваш тип свойства был инициализирован через указанное событие.

Как добавить запуск своего класса/метода агентом в 1с-Битрикс?

Пробовали менять тип агента периодический/не периодический?
Часто бывает на сайте в целом один тип агентов не работает из-за некорректной настройки агентов на cron.

Также у вас агент возвращает некорректный ответ, он выполнится всего один раз.
Нужно поправить на его полный вызов - \lib\Shop::someMethod();

Из за чего происходит не перекидывет на страницу 404 при несуществующем запросе?

Cyber-Pavel, у вас условие умного фильтра попадает под проверку, и он часть которая не укладывается в проверку пытается распарсить как фильтр судя по всему, вместо ошибки.

Попробуйте строку поправить и посмотреть на результат, скорее всего 404 появится.

"smart_filter" => "#SECTION_CODE_PATH#/#SMART_FILTER_PATH#/",

на

"smart_filter" => "#SECTION_CODE_PATH#/filter/#SMART_FILTER_PATH#/",

Из за чего происходит не перекидывет на страницу 404 при несуществующем запросе?

Cyber-Pavel, что у вас в файлах /catalog/index.php и 404.php?

Как подключить свой кастомный файл header?

webhero, вам не нужно указывать самостоятельно путь до новой шапки.

Подключайте на странице как и раньше

require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/bitrix/header.php");

Аналогично и с подвалом.

Эти пути вообще трогать не нужно, там не только шапка сайта подключается, а в целом ядро и сопутствующие модули.

Как подключить свой кастомный файл header?

webhero всё корректно прописали, теперь на странице где вам нужно посмотреть другой шаблон добавляете в URL либо ?header2=true либо &header2=true в зависимости есть или нет там уж какие-то параметры - и вот он, новый шаблон.

Как подключить свой кастомный файл header?

Можете добавить проверку в старый шаблон для отображения новой шапки только для определённого пользователя, но шанс что что-то сломается выше.

if($USER->GetID() == 1) {
Код новой шапки
} else {
Код старой шапки
}

Вариант с копией шаблона более безопасный, когда нет понимания как работает битрикс.

Почему следующий цикл НЕ бесконечный?

gvg1, скорее всего вы пытаетесь решить проблему не верным инструментом, и если сформулируете изначальную задачу - вам смогут предложить подходящее решение.

Не знаю зачем оно вам надо, но для бесконечного цикла можно использовать
while(true) {}

Как из JSON забрать значения и передать их в html (php)?

sergise, вы можете обращаться к элементам массива, если знеате названия ключа.
Это основы, можете освежить знания опять же в документации по массивам.

Или, как правильно отметил RelShine - пройтись по всем странам циклом и вывести как их ключи, так и нужные значения.

Как в битриксе один элемент расположен в двух разделах без привязки?

Он точно не привязан к разделам?
В селекторе битрикса иногда есть баг, когда не показано какие пункты выделены, и выделение отображается только при фокусе на элементе.
Можете через Ctrl кликнуть в какой-нибудь раздел селектора чтобы не слетели старые привязки и перепроверить что там точно нет выделенных разделов.

Судя по кнопке "Вернуться" на сайте, основным разделом вашего товара являются "Инъекционные материалы для гидроизоляции", а "Инъекционные материалы" - дополнительным.

Как заблокировать обновление моего решения, если например: версия PHP ниже?

Сергей Зверев, документация по обновлениям несколько запутана и не полная, но в целом по ссылке что привёл - основное написано.
Также имейте в виду - там есть информация про version_control.txt. Этот механизм не работает таким образом как там написано полагаться на него не стоит, и в целом можно не использовать.

Как изменить url в sitemap Битрикс?

lid2pro, контент->типы инфоблоков в админке.

Как правильно сделать триггер в для триггерной рассылки?

Яков Кравцов, отметьте решением, если не затруднит.