Это зависит от контетна окна. Например анимация в ForkLift(файловый менеджер аля TC) в котором открыто две панели с большим количеством файлов менее плавная, чем когда открыта одна панель без файлов.
В общем, оно и не удивительно: на обновление сложного контента требуется больше ресурсов, чем на обновление пустоты. Видимо система ограничивает потребление ресусрсов на данную анимацию. В свою очередь анимация сворачивания окна в док не требует обновление контента, поэтому и не тормозит.
В сети жалобы есть, большинство людей просто отключают анимацию. И они в основном от Windows/Linux пользователей, а кореные маководы просто привыкли и не сильно замечают это :)