Михаил

function getPlayers(a = 5, skip = 0) {
  return PlayersInQueue.splice(skip, a);
}

function getTeam(FindPlayersToTeamCount = 20, skip = 0, team = [], availableLines = [1, 2, 3, 4, 5]) {
  let tempTeam = getPlayers(FindPlayersToTeamCount, skip);

  for (let i = 0; i < tempTeam.length; i++) {
    let player = tempTeam[i];
    let mainLine = player[0];
    let secondLine = player[1];
    let isAutoFill = player[2] === 1;

    if (team.length === 5) break;

    if (mainLine === 6 || isAutoFill) {
      // любая линия или сработал autofill
      player[0] = availableLines.shift();
      team.push(player);
    } else {
      // ищем основную или второстепенную свободную линию
      let mainLineId = availableLines.indexOf(mainLine);
      let secondLineId = availableLines.indexOf(secondLine);

      if (mainLineId < 0 && secondLineId < 0) continue;

      player[0] = availableLines.splice(mainLineId > -1 ? mainLineId : secondLineId, 1)[0];
      team.push(player);
    }
  }

  tempTeam = tempTeam.filter((p) => !team.some((p2) => p[3] == p2[3]));
  PlayersInQueue = tempTeam.concat(PlayersInQueue);

  if (team.length === 5) {
    return team;
  }

  // Если мы не смогли собрать команду нам нужно запустить поиск заново, но только для тех линий которые остались (в этом скорее всего и была ошибка по мимо остальных недочетов)
  getTeam(20, tempTeam.length, team, availableLines);
}

FindTeam.splice(FindTeam.indexOf(TeamStorage[i][0]));

<video controls autoplay loop muted playsinline>
     <source src="#" type="video/mp4">
     Your browser does not support HTML5 video.
</video>