Не надо сразу лезть в дебри, strace вам ничего не даст.
Для начала посмотрите:
1) Какой процесс грузит проц (top, htop и тп.)
2) Трафик по логам http сервера отличается ли он от прежнего и от ожидаемого.
3) Трафик на сетевухах, отличается ли он от прежнего и от ожидаемого.
И только потом делайте выводы. Может просто на сайте разместили убер статью которая привлекла 100500 человек