Основная таблица - Модели - три колонки:
id | Имя модели | Основная модификация
Таблица модификаций:
id | Имя модификации | модель_id
Характеристики либо хранить в колонках модификаций, что не очень хорошо, т.к. бы будем завязаны на структуре БД. Либо создать отдельную таблицу с характеристиками:
Модификация_id | Название характеристики | Значение характеристики
Сам характеристики можно вынести в отдельную таблицу.