Заранее хотелось бы ответить на вопрос «Разве сложно перейти по ссылке и откомментировать уже в самой системе?»
1. Уменьшение одного действия — уже экономит время.
2. Почти везде система управления проектами находится в интрасети, доступ к которой из миру закрыт. А так можно участвовать в процессе обсуждения даже с мобильного телефона. Пришло сообщение на почту — сразу отписал. Процесс не стопорится.