В вопросе явно dconf указан. Вы зачем-то synaptics приплели.
В вопросе явно указано оболочка gnome. А поставить ее без dconf не выйдет.в вопросе текст:
После удаления расширений для Gnome, параметры этих расширений остались. Я установил утилиту dconf.Интересно, как по вашему тогда был гном без дконфа?
Все гномовские приложения хранят настройки в dconf.Что простите? Графическая оболочка хранит настройки в утилите редактирования настроек? Это как? А что тогда с synaptiс? Почему он тоже "отображает остатки и хвосты" настроек, или они ещё и в синаптик (по вашей логике) прописываются?
Поиск по ошибкам выдал пару статей по похожей проблеме. В первой есть совет отрубить UAC, но не уверен что поможет.
Во второй есть ссылка на хотфикс.
Какая из статей полезнее - судить вам.
Можно ещё раз, но подробнее загуглить эти ошибки.