В общем, попробовал практически все плагины по поиску "FTP", остановился на варианте Remote FS. Он конечно достаточно своеобразно настраивается через Рабочие области и общие настройки, но работает неплохо.

И все же, было бы здорово, если бы кто-то форкнул remote-ftp под VSCode.

Нужно проверить, чтобы у файлов был тот же владелец, что и пользователь Apache. Кроме того, выставить необходимые права на папки и файлы.
chown bitrix:bitrix file.php

Для массовой смены владельца можно использовать:
find . -type f -exec chown bitrix:bitrix {} \;

Вот универсальное решение:

cd /home/bitrix/www
find . -type d -exec chmod 775 {} \;
find . -type f -exec chmod 664 {} \;
find . -type d -exec chown bitrix:bitrix {} \; 
find . -type f -exec chown bitrix:bitrix {} \;

/home/bitrix/www — директория где лежит сайт
bitrix:bitrix — пользователь и группа под кем запущен демон httpd
Пользователя и группу можно подсмотреть в phpinfo.

Используйте mozjpeg - он дает отличные результаты. Вот мой конфиг:

var gulp   = require('gulp'),
    chalk = require('chalk'),
    plugin = require('gulp-load-plugins')(),
    browserSync = require('browser-sync').create();
plugin.imagemin.mozjpeg = require('imagemin-mozjpeg');
plugin.imagemin.pngquant = require('imagemin-pngquant');

gulp.task('img', function () {
	gulp.src(path.src.img)
		.pipe(plugin.plumber({
			errorHandler: plugin.notify.onError("Ошибка: <%= error.message %>")
		}))
		.on('end', function(){ plugin.util.log(chalk.cyan('Инициализирован обработчик ошибок изображений')); })
		.pipe(plugin.imagemin([
            plugin.imagemin.gifsicle({interlaced: true}),
            plugin.imagemin.jpegtran({progressive: true}),
            plugin.imagemin.mozjpeg({progressive: true}),
            plugin.imagemin.optipng({optimizationLevel: 7}),
            plugin.imagemin.pngquant({quality: '85-100'}),
            plugin.imagemin.svgo({plugins: [{removeViewBox: true}]})
        ]))
		.pipe(gulp.dest(path.build.img))
		.on('end', function(){ plugin.util.log(chalk.cyan('Оптимизированы изображения')); })
		.pipe(browserSync.stream());
});