Я делал так.
Пользователю с ролью super_manager добавлял форму с добавлением юзера с ролью manager. дальше в отдельной таблице с настройками пользователей, дабы не хранить все это в user_meta сохранял id друг друга и уникальный хэш.
Для определения связки дочка/родитель проверяется нахождение id друг друга и совпадение хэша.
