Как пользоваться JMeter, чтобы нагрузить сайт?

Для начала нужно записать скрипт. Затем определиться с ожидаемой нагрузкой, установить необходимое количество виртуальных пользователей и запустить тест. После чего проанализировать результаты.
Вот здесь описано как записать сценарий в JMeter

Что в программе показывают графики?

Для отображения графиков используются контролы типа Listener. Например Graph Results

Да, напоминание от самого JMeter:
Не используйте GUI режим для нагрузочного тестирования! Он предназначен только для создания и отладки тест плана.
Для нагрузочного тестирования используйте NON GUI режим:
jmeter -n -t [test.jmx] -l [resultfile.jtl]

Ограничение, судя по всему, по географии.
В Бразильском сторе скачать можно.
В Российском и US, судя по топику на офф сайте, нельзя, а почему - нет реакции.

На мой взгляд идеальным решением будет размещение информации о запуске вашего сайта на профильном этой теме (теме сайта) сообществе. Они как никто другой смогут дать наиболее ценные комментарии по нему.