Map/Reduce — одно из главных направлений развития MongoDB, производительность её на таких операциях (если всё сделано грамотно) гораздо выше, чем на MySQL. однако не стоит по одному этому поводу сразу бросаться её использовать. у mongo оочень много подводных камней, о которых вы никогда не задумывались в MySQL, как то: агрессивное кеширование всего data-set'а (нет смысла запускать mongo с большим набором данных, если там крутится ещё что-то кроме монго) и global write lock (монго в общем-то создана для быстрого чтения, но вставка в ней — ад и ужас)