Иван

Сначала ты собираешь ссылки, которые будешь парсить. Так вот запиши эти ссылки в отдельную таблицу. В следующий раз при сборе ссылок собственно получай ссылки, которые уже есть и исключая их, оставляй новые

В оригинале такие ссылки
https://site.ru/news/50/ostorozhno
нужны такие
https://site.ru/50-ostorozhno
желательно на конце со слешем или без, сейчас оба варианта работают.

RewriteRule ^(\d+)-([^/]+)$ news.php?id=$1&slug=$2

Если нужен в конце /

RewriteRule ^(\d+)-([^/]+)/$ news.php?id=$1&slug=$2

Ну и добавить свою страницу 404.
ErrorDocument 404 /notfound.php

Нужно как минимум хранить время создания кода. Если не хочется городить MySQL/MariaDB/PostgreSQL/etc, то можно сделать sqlite-базу. По крайней мере не придётся велосипедить средства для поиска и удаления записей.

Вот вы и столкнулись с задачей, несовместимой с планом сделать все на коленке без “излишков” вроде БД и фреймворка.

На текстовом файле сделать можно, но это сломается при почти-одновременных запросах и будет заметно тормозить. С очередным пином есть 4 варианта: нет в списке, есть и ранее не использовался, есть и прошло менее 90 дней, есть и просрочен. В 2 из них надо вносить в файл изменения: помечать время или удалять запись. Для файла нет операции “вставить в середине или удалить из середины файла байты с А по Б”, поэтому придется создавать новый файл, переписывая все строки кроме удаляемой, и потом заменять старый файл новым.
Медленно и неэффективно.

Все-таки разберитесь с MySQL. Это модно, спортивно, современно.

Лучше всего воспользоваться базой данных. Сейчас практически в любой можно реализовать Time To Live, по сути - срок жизни записи.
В комментах вы пишите, что запросы будут приходить часто и много - в этом случае действительно с файлом могут возникнуть проблемы.
Если вас смущает накладные расходы на обращение к данным в БД - прочитайте про IN-MEMORY. В MySQL кстати оно есть (не помню в какой версии, в MariaDB 10 точно видел упоминание).
Лично я бы взял Redis и работал бы с ней, благо данных не много, ОЗУ много не потребуется. А работает она очень быстро. И функциональность достаточная, что потом может пригодится для хранения других данных или например для реализации очередей, хранения сессий, оповещений и т.п. А TTL там заложено на уровне движка - добавляете запись, при добавлении можно сразу установить срок жизни в секундах и запись сама удалится по истечении времени. А можно без указания TTL (в 0) и тогда запись не удалится.
Так и вижу - заносите доступные пин-коды с TTL=0, а когда их активируют - указываете для записи TTL нужной длительности и с момента первой активации начинает тикать счетчик. Удобно же и никаких велосипедов изобретать не надо. С Redis работать просто почти в любом ЯП сейчас, очень простое и легкое API.

Использовать CURL?

$curl = curl_init();
 
$url = "https://site.ru/test.php";
 
$args = array(
	'id' => '1',
	'user_id' => '100'
);
 
curl_setopt_array($curl,
    array(
	CURLOPT_URL => $url,
	CURLOPT_POST       => true,
        CURLOPT_POSTFIELDS => $args,
        CURLOPT_RETURNTRANSFER     => true,
    )
);
$data = curl_exec($curl);
curl_close($curl);
echo $data;