d'Ivan

1. Ничего особого не требуется
2. Без разницы
3. Имеет смысл хранить хэш-сумму (MD5, SHA1) рядом с файлом и сверять архивы по ней для удостоверения целостности.
4. Возможно, разбивать потенциально большие архивы на тома, скажем, по 20-50 МБ, чтобы в случае обрыва связи было проще перезалить в облако.
5. Очень даже может быть. Во времена магнитных накопителей имело смысл создавать архивы с некоторыми дополнительными служебными данными, используемыми при восстановлении файлов в случае повреждения, вызванными размагничиванием или при записи. Сегодня это неактуально и, в основном, ненадежный канал связи может являться причиной битых архивов. При использовании программ для синхронизации данных не исключено, что при обрыве связи не работает как положено механизм повтора.

Bash:

tar xf названиеархива.tar.gz
# затем распаковываем все .gz в поддиректориях на своих местах:
find . -type f -name '*.gz' -exec gunzip {} \;

CSV - это текстовый формат для обмена между различными программами и он отлично сжимается. Этот формат не имеет прямого отношения к Excel, а просто ассоциирован с ним в Windows и при его открытии происходит операция импорта.

ZIP - это контейнер, в который можно сжимать файлы с различными алгоритмами сжатия. Если используется WinZIP из последних версий, то в нем есть поддержка сильных алгоритмов сжатия, таких как BZIP2, LZMA.

Имеет смысл импортировать CSV в какую-либо нормальную БД, ну хоть в Access.