на все папки и файлы внутри папки "var",
Это капец... необдуманно.
Ладно, мысль такая:
1. Выполняем
переименование директории:
sudo mv /var/lib/mysql /var/lib/mysql-broken
2. Переименовываем директорию конфигурации /etc/mysql аналогично.
3. Восстанавливаем директорию данных из пакета переустановкой пакета:
apt-get -o Dpkg::Options::="--force-confmiss" install --reinstall mysql-common
apt-get -o Dpkg::Options::="--force-confmiss" install --reinstall mysql-server
То есть мы сначала восстановили пакеты по умолчанию. Они должны содержать правильные права доступа на файлы в
/var/lib/mysql ,
/etc/mysql.
Далее, сравниваем права директорий и файлов с директориями с суффиксом
-broken и восстанавливаем правильные.
По окончанию удаляем установленные с пакета и переименовываем с суффиксом
-broken на прежние места.
Пробуем запустить сервер и смотрим на ошибки. Исправляем пока не запустится. Как-то так.
Писал с телефона, не проверял.
Добавлено
С другими пакетами аналогично.
Порой проще переустановить с нуля чем исправлять.
