Простых вариантов нет (DCI и JTAG отладчики x86 стоят как чугунный мост и вы их не достанете)
Есть альтернативный CS# для второго биоса, но остальные линии общие. Есть другие SPI, но они не для биоса.
Вы уверены, что логические выводы SPI пожгли? Проверьте анализатором, возможно, сдохла только SPI флешка и на линиях есть сигналы.
Ладно BIOS, но на той же флешке образ ME и конфиг для проца и материнки, без этого мало что заведется