Ваш класс БД будет работать с таблицами. Зачем ему лезть в файлы? Его задача (и единственная ответственность) - прослойка между кодом, который обращается к БД, и кодом, который реализует хранение. Не нужно в него совать куски ни из того, ни из другого.
Сделайте таблицу отдельным классом, который принимает имя файла в конструкторе. В нем уже читайте и пишите данные в файл.
Сделайте фабрику, которая по имени файла выдает класс таблицы-файла либо создает его, проверяя наличие такого имени в системе и инкапсулируя в себе ВСЮ логику имен файлов, путей и проч. Классу БД об этом знать незачем, классу таблицы - тем более.
В общем, делите код на то, что надо сделать вот здесь на этом уровне логики, и выкидывайте из него все, что требует опуститься на уровень ниже, в соответствующие классы. И работайте только с их методами, не вникая в реализацию. Не размазываете реализацию конкретных вещей по коду - собирайте ее в одно место, и пусть за нее отвечает только один класс.
